В настоящее время тема последствий для человека контактов с НЛО вызывает оживленный спор среди уфологов. Часть уфологов придерживается мнения, что такие контакты представляют смертельную опасность, другая часть, что они не более опасны, чем бытовая техника.
Сторонники безопасной теории утверждают, что НЛО не представляют какой-либо угрозы для человека. Случаи нанесения ими ран и травм немногочисленны и могут объясняться неадекватным поведением самого человека. Инопланетянам, которые обладают более совершенными технологиями, ничего не стоит уничтожить все человечество разом. Однако они этого не делают.
Сторонники второй теории утверждают, что НЛО смертельно опасны. В качестве подтверждения своей теории они приводят воспоминания людей, подвергшихся похищению и многочисленные находки трупов животных с увечьями непонятного происхождения. Люди, подвергшиеся похищению, испытывают долговременные сильные боли в области головы и живота, часто страдают бытовой забывчивостью, не помнят многие моменты своей жизни. Их тела нередко покрыты шрамами, язвами и ожогами. При детальном изучении последствий создается впечатление, что инопланетяне проводят над людьми генетические эксперименты.