Становление уфологии как относительно научной дисциплины приходится на 60-90-е годы 20 века. Определенную роль в этом сыграли такие всемирно известные ученые как Жак Валле, Джеймс Мак-Дональд, Аллен Хайнек и Филип Класс. В России у истоков уфологии стояли Александр Петрович Казанцев, Феликс Юрьевич Зигель и Владимир Георгиевич Ажажа.
В 1947 году в Московском планетарии была прочитана лекция «Загадки Тунгусского метеорита». Лекторами были А.П. Казанцев и Ф.Ю. Зигель. После лекции развернулась обширная дискуссия, результаты которой немного позднее были опубликованы в широкой прессе. Так были заложены основы уфологической науки в России. В США интерес к этой теме также возник в 1947 году – после крушения НЛО под Розвуэллом.
С 1956 года вопросами НЛО стала заниматься большая группа советских ученых. У ее истоков стоял профессор Юрий Александрович Фомин и два его помощника – Б.В. Макаров и В.М. Гуликов. Помимо научной работы они проводили и публичные лекции. В 1961 году группа была распущена, а Ю.А. Фомин исключен из числа научных работников.
Вторичный всплеск интереса к вопросам уфологии в Советском Союзе произошел в 1962 году. Катализатором этого стала книга Иосифа Самуиловича Шкловского «Вселенная. Жизнь. Разум», в которой он затронул вопросы существования инопланетной жизни в Космосе. В 1967 году в Москве была вновь сформирована группа по исследованию вопросов НЛО. В ее состав вошли 45 человек. Руководил ею генерал-майор П.А. Столяров, почетным председателем был выбран Ф.Ю. Зигель.
К 1990 году уфологические центры появились уже и в других городах – Северодвинске, Новосибирске, Томске и Нижнем Новгороде. В дальнейшем из них вышли такие известные отечественные уфологи как В.Г. Ажажа, Р.Г. Варламов, Э.А. Ермилов, В.Н. Лунев, А.Е. Семенов и Б.А. Шуринов. После распада Советского Союза большинство их этих групп распалось. В 2000 году остатки многих групп объединились в ассоциацию «Экология непознанного», которая действует вплоть до настоящего времени.